Jesper Håkansson blev præsenteret i Lyngby d. 22. august 2007 som en forstærkning til A-truppen. Han har mange ungdomslandskampe på bagen og modtog i 1997 Arlas U/17-talentpris. Håkansson fik debut i udekampen mod AGF d. 27. august 2007, en kamp som endte 0-0. Han scorede sit første mål i pokalkampen mod Glostrup d. 29. august 2007, en kamp som Lyngby vandt 2-0.
Efter blot en enkelt sæson hos de kongeblå skiftede Håkansson til australske Newcastle Jets på fri transfer.
