Kasper Kristensen havde som mange andre Lyngbyspillere sin fodboldbarndom i Virum-Sorgenfri. Som ungdomsspiller i Lyngby var Kasper en stabil spiller på det bedste junior- og ynglingehold, samt diverse U-landshold. Han fik sin førsteholdsdebut d. 27. marts 2004 i udekampen mod HIK, en kamp som endte 4-4. I hele 2005 og 2006 var Kasper en vigtig brik i spillet på Lyngbys bedste mandskab, men fik sidenhen revet 2 sæsoner ud af sin karriere pga. skader. I foråret 2008 blev Kasper endeligt kampklar og startede op på Lyngbys U-hold.